Dalam usaha meningkatkan sistem penyampaian perkhidmatan yang lebih berkesan kepada pelanggan penubuhan sebuah Pusat Dokumentasi telah dapat direalisasikan oleh pihak pengurusan PERZIM pada tahun 2019. Penubuhan Pusat Dokumentasi ini bagi memudahkan pengurusan, penyimpanan dan akses ke atas kesemua koleksi buku, pelan, peta, bahan audio visual, bahan digital, manuskrip dan lain-lain bahan rujukan yang ada dalam simpanan PERZIM.
Pada tanggal 8 Februari 2023, Pusat Dokumentasi PERZIM telah dirasmikan penubuhannya oleh YBhg. Datuk Akramuddin bin Ab. Aziz, Pengerusi Lembaga Pengarah PERZIM. Terdahulu koleksi bahan perpustakaan muzium ditempatkan di beberapa bilik yang terhad di beberapa buah muzium seperti di Muzium Islam Melaka, Muzium Belia Malaysia dan Unit Konservasi dan kini fungsi Pusat Dokumentasi PERZIM diperluaskan sebagai pusat Penyimpanan Setempat (One Stop Centre) koleksi perpustakaan berkaitan dengan sejarah dan warisan Melaka dan Malaysia amnya selain memberi khidmat perpustakaan dan bahan rujukan kepada penyelidik dalaman dan luaran.
Sehingga kini kerja-kerja mengenalpasti, mengumpul, merekod, mendaftar koleksi bahan ke dalam sistem pengurusan koleksi perpustakaan terus dilaksanakan oleh Bahagian Penyelidikan dan Dokumentasi PERZIM. Majlis dihadiri sama oleh YBrs. Puan Fadhilah binti Md Saleh, Pengurus Besar PERZIM, pegwaai-pegawai kanan PERZIM serta kakitangan perbadanan.